Afera wizowa
W 2005 roku był głównym bohaterem afery, którą niemieckie czwarta rząd nazwały Aferą wizową. Na jaw wyszło, że w ministerstwie spraw zagranicznych dochodziło do masowych przesadzić systemu wydawania wiz w konsulatach niemieckich głównie w krajach Europy Wschodniej (Ukraina, Rosja, Mołdawia). z tego powodu, Fischer był głównym świadkiem, którego przesłuchiwała komitet śledcza Bundestagu (Untersuchungsausschuss).